上海市儿童医院小儿泌尿外科成立于20世纪70年代，是国内最早单独建立的小儿泌尿外科专业科室之一。科室每年门急诊量超35000人次，每年手术量超4000例次，其中40%以上为III级以上手术。目前科室有主任医师3名，副主任医师3名，主治医师4名，住院医师4名，助理研究员1名。
泌尿外科能开展小儿泌尿外科所有诊治业务，包括包茎、隐匿阴茎、隐睾、鞘膜积液、腹股沟疝、遗尿等常见疾病；肾积水、膀胱输尿管反流、尿道下裂、泌尿系统结石、肾脏肿瘤、睾丸肿瘤、膀胱肿瘤等重大疾病和尿道上裂/膀胱外翻复合畸形、性发育不良等复杂少见疾病。是上海交通大学先天性泌尿生殖系畸形外科疾病诊治中心和上海交通大学医学院儿科学院“尿道下裂临床研究中心”，和上海市儿童医院“尿道下裂中心”和上海市儿童医院“儿童性发育异常诊治中心”。在全国小儿泌尿系统率先开展机器人辅助手术。科室配备各种微创腔镜设备，拥有独立的尿流动力室和实验中心。
现有博士生导师1名、硕士生导师1名，获多项国家自然科学基金及国家教育部、卫生部、上海市科委、上海市卫生局基金的资助，每年均有临床和基础研究成果发表于SCI及中华系列期刊。参与编译“实用小儿泌尿外科学”和“坎贝尔泌尿外科学（小儿泌尿部分）”等小儿泌尿外科经典专著。
