上海市儿童医院检验科创建于1954年，两院区运行，是上海交通大学医学院博士、硕士点、上海市卫健委临床重点专科、医院优势学科。现设置临床检验、感染、免疫、细胞、遗传、血库六个亚专科。

　　检验科现有医疗、技术、科研人员103名，其中高级职称13名、中级职称11名，博士生导师1名、硕士生导师1名。博士学位8名，硕士研究生23名，本科以上学历占92.89%。科室注重青年人才培养，近年来多人获得医院优秀青年培养计划和上海优秀青年临床医技人才（临床检验专业）培养资助计划。

　　科室拥有各类大型分析仪器设备，包括全自动生化免疫流水线、全自动化学发光仪、全自动药物浓度分析仪、全自动特定蛋白分析仪、全自动尿沉渣分析仪、全自动凝血分析仪、全自动血培养仪、全自动细菌鉴定仪、微生物质谱仪、全自动五分类血球分析仪、串联质谱分析仪、流式细胞仪、一代、二代、三代基因测序仪、染色体扫描分析系统等先进设备，开展各类检验项目450项，年标本量逾100万人份。为临床、科研和教学提供了良好的条件。

　　ISO 15189的管理要求为基础建立了管理体系，对实验室质量管理进行持续改进，北京西路院区在2013年通过了ISO 15189的认可，泸定路院区也在2018年认可。并在卫生部临检中心、上海市临床检验中心的历次室内、室间、盲点考核中我们取得优异成绩。为保障检验质量，支持临床诊疗提供了制度的保障。

　　儿童感染性疾病诊断、分子遗传诊断是我们的优势学科。检验科临床微生物研究室，是交大医学院重症感染与免疫研究院的重要组成部分，是首批加入上海地区细菌耐药性监测网和全国CHINET细菌耐药性监测网的儿童专科单位，也是全国细菌耐药监测网首家儿童示范培训基地，在儿童苛养菌培养、儿童细菌耐药监测方面具有全国影响力。分子遗传方面我们是全国第一批临床基因扩增试点单位，拥有完整的一、二、三代基因测序平台，年检测量超千人次，为儿童遗传病、罕见病的诊治提供了有力保障。

　　近年来，上海市儿童医院检验科积极开展科研工作，近年来先后承担了国家自然科学基金项目5项、上海市科委自然基金项目3项，上海市卫生局课题3项，与临床合作参与多中心的国家自然科学基金项目、国家科技部“十一五、十二五、十三五”攻关课题、国际合作多中心研究项目多项。近五年获得科研经费近六百余万，在SCI收录期刊和核心期刊上发表四十余篇论文，申请发明专利多项，获授权实用新型专利两项，成果转化一项。为学科发展提供了强大的后劲。