药学部忠实履行“为儿童服务就是幸福”的医院宗旨，2011年率先实施药品承诺制服务改革，努力践行药学服务的转型升级和高质量发展。现已成为集药品供应保障、药品调剂、药事管理、临床药学服务及科研教学为一体的综合性专业技术部门，现有药学专业技术人员101人，其中主任药师2人、副主任药师7人；含博士3人，硕士7人。目前有硕士生导师1人，国家卫健委紧缺人才药师岗位师资4人，中华医学会临床药师培训基地师资4人。药学部是上海市临床药学重点专科，上海市重点薄弱学科建设单位，中国医药教育协会儿童用药评价分会主任委员单位，上海市药学会药学科普学组组长单位，沈阳药科大学和蚌埠医科大学临床药学专业硕士研究生导师受聘单位，上海健康医学院药学本科生实习单位。

　　围绕儿童个体化精准用药、安全合理用药科普、临床用药综合评价和药品不良反应信号数据挖掘等方向开展系列研究。近年，作为首批试点单位参与国家药品与卫生技术综合评估中心委托药品综合评价工作，承担国家自然科学基金委面上及青年等国家及省、市级课题30余项。荣获中国医院协会医院科技创新三等奖、中华医学科技奖-卫生管理奖、上海市药学科技奖（应用类）二等奖等各类奖项20余项，累计发表期刊论文100余篇，其中SCI 40余篇，获得专利12项。作为执笔单位，完成《药师开展科普活动专家共识》、《川崎病治疗用药临床综合评价操作规范》和《临床药学服务—治疗药物监测》三项行业规范编制工作。团队参编药学指南、专著等14项。主办八届国家级继续教育学习班《儿童个体化基因检测及药物治疗新进展》。

　　药学部坚守“文化立心、服务立命”的科室文化，以患儿为中心，提供全程化药学服务。门诊药房配备了全自动发药机、物流机器人等智能设备，开展处方前置审核、点评工作。建立了“门诊药品自动调剂+网络微信问答”药学服务体系，全天候对患儿及家长进行用药指导。开通上海市首家互联网云药房，寄药到家服务满足在医院互联网诊疗平台就诊患儿的用药需求，年服务患儿近2万人次。住院药房和静脉配置中心承担病房药品的供应和调剂工作，持续推进住院患儿的分剂量个性化调剂工作。药库承担全院药品的采购、保管、发放及药品信息维护工作，同时为合理用药提供信息、数据支持。

　　临床药师深入各临床科室，深度参与临床疾病的药物治疗管理，借助药物基因检测、治疗药物监测和模型引导的精准用药等药学服务手段，参与制订个体化药物治疗方案，参加联合查房、药学会诊；为病区患儿提供用药医嘱审核、药学监护、用药教育等药学服务。同时开设精准药学门诊，全程化随访、服务、指导患儿合理用药流程，保障遗传特异质患儿的用药安全。临床药学科承担国家紧缺人才药师师资岗位、中华医学会临床药师学员培训和药学本科生实习单位等教学任务，近五年培养临床药师28人次，研究生3人次和本科生5人次。