上海市儿童医院心内科成立于上世纪50年代，是集医疗、教学、科研为一体的临床科室，也是最早开展儿童先天性心脏病介入治疗及电生理检查治疗的单位之一。上海市市级临床重点专科，上海市儿童医院优势学科，国家GCP临床药物试验基地，上海市新生儿先天性心脏病筛查诊治中心，晕厥诊治中心，儿童心律失常诊治中心，中国无创心脏电生理上海培训中心。为中华医学会儿科分会委员、中华医学会儿科分会心血管学组委员兼秘书、上海医学会儿科组委，上海医学会小儿心血管组组长单位。致力于提高儿童常见、罕见、以及疑难儿童心血管系统疾病的综合诊治能力和临床管理。开展了几乎涵盖整个专业领域的业务，包括高风险、高难度的先天性心脏病介入、难治性心律失常射频消融以及起搏器植入等手术，外周血管畸形的介入治疗，同时在治疗爆发性心肌炎、川崎病、肺动脉高压、高血压、咯血、消化道大出血、血管瘤介入等方面具有丰富的临床经验以及良好的治疗效果。

　　心血管内科配备有C-LAB4000多导电生理仪、ComboLab多导电生理导航系统、39D-79X射频消融系统、IMEC10多参数心电监护仪、M-SERIES除颤仪、美敦力临时起搏器、MAC十二导心电图机等。心功能室配备有GE及labtech平板运动测试系统、巨驰直立倾斜床、DF-5A心脏电生理自己仪、PHILIPS EPIQ7、IEilite、EPIQ5及CX50心脏超声仪（配有食道超声探头及经胸三维超声探头）、博英动态心电记录盒、博英便携式动态血压监测仪。医院相关科室配有SPECT/PE-TCT、64排双源螺旋CT、320层螺旋CT、MRI、PHILIPS双C臂DSA机等大型设备。心血管专用DSA设备、Carto3、HOLTER、ECHO均正常投入临床使用，产生了较好的经济效益与社会效益。本科室年出院人次约1400余人次，门急诊人次近五万人次，2024年共完成各种心脏手术一千余台。

　　科室承担上海交通大学医学生的临床教学任务，是上海交通大学临床医学硕士及博士研究生培养点，及博士后培养点，多次应邀参加全球多中心恶性心律失常，心衰、川崎病的GCP项目。主持国家自然科学基金、省部级及局级重点项目及重大项目，近五年在主流期刊Nat Commun, Commum Biol ,Europace,Eur J Med Genet发表高质量SCI论文，获专利两项，上海II类创新医疗器械一项。