医院现有泸定路和北京西路两个院区，开放床位730张。设有30个临床科室和7个医技科室，是上海市儿童早期发展基地，是上海医学遗传研究所、上海市儿童急救中心、上海市危重新生儿会诊抢救中心、上海市新生儿代谢病筛查中心、上海市儿童康复中心、上海市听力障碍诊治中心所在地，是上海市新生儿先心筛查诊治中心依托单位以及上海市人工耳蜗植入手术定点医疗机构。医院2024年门急诊逾268万人次，出院逾5.3万人次，手术逾2万人次，业务量位列上海儿童专科医院前列。
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